Der Spieler schlüpft in die Rolle von Jennifer, die eines Tages mitsamt ihren Freunden von einer vornehmen Dame namens Mary adpotiert werden. Sie erwarten ein wundervolles neues Zuhause, dass sich Barrows Mansion nennt, in dem sie zusammen mit Mary und Mr. Barrows leben werden. Leider kommt alles anders als erhofft, denn Jennifer's Freunde werden eines Nachts nach und nach tot aufgefunden. Während dies passiert, verschwindet Mary und Jennifer wird von einem Psychopaten gejagt, den sie nur als den "Scissor Man" kannt.

"Clock Tower" präsentiert sich als klassiches Point and Click-Adventure, das jedoch stark mit Fluchtsequenzen angereichert wird, die den Puls des Spielers im Gegensatz zu anderen klassischen Adventures drastisch in die Höhe treibt. Da ein Mädchen im Teenage-Alter gespielt wird, verfügt die Spielfigur über keinerlei besondere kämpferischen Fähigkeiten und ist allein auf die Interkationsmöglichkeiten der Umgebung (zum Bespiel Verstecke) angewiesen. Und selbstverständlich auf die Schnelligkeit der eigenen Beine.

Als das Spiel ursprünglich auf dem SNES released wurde, stellte es aufgrund seiner erwachsenen Thematik und seiner hervorragenden audiovisuellen Präsentation eine kleine Sensation dar. Später wurde das Spiel auch auf der Playstation veröffentlicht. Beide Releases fanden leider nur in Japan statt.